Getta Robot ora deve vedersela direttamente con Gool e la sua titanica fortezza. A complicare la situazione ci sono anche altri due Megazaus e una flotta di caccia che mettono a ferro e fuoco la città.
Il Getta purtroppo deve ritirarsi ed assistere impotente all'avanzata dell'Impero dei Dinosauri, inutilmente contrastato dall'esercito giapponese.
Ma il professor Saotome ha in mente una contromossa per eliminare la base corazzata: è necessario sparare un missile nelle fauci di uno dei brontosauri che trainano la corazzata. Esso però è un missile speciale: è composto da 3 moduli, ognuno dei quali viene trasportato da una Getter Machine ed è necessario combinarlo in volo, prima di centrare il bersaglio.
Dopo un breve periodo di prova i tre piloti decollano alla volta del campo di battaglia e, dopo aver distrutto un terzo Megazaus, affrontano il nemico. La manovra di aggancio del razzo però fallisce a causa del fuoco nemico e di un'incertezza di Musashi e le tre navette, danneggiate seriamente, prendono fuoco ed esplodono al suolo, costringendo i piloti ad un lancio con paracadute.
Tornati al laboratorio cade lo sconforto: senza il Getta Robot come sarà possibile affrontare il nemico? Il professore, determinato a combattere il malefico impero, decide di salire a bordo dell'unico mezzo funzionante, la Macchina Comando di Michiru. Musashi tuttavia, sentendosi responsabile del fallimento dell'azione, precede il professore e si dirige verso la fortezza nemica dove i dinosauri stanno festeggiando la distruzione del Getta Robot e l'imminente conquista del mondo.
Con un'ultima ed eroica azione suicida Musashi si getta nelle fauci del mostro e il modulo esplosivo allegato alla navetta brilla nel cuore della base nemica, facendola esplodere con tutti i suoi occupanti, eliminando per sempre il Grande Diavolo Uller, Re Gool e tutto l'impero dei dinosauri dalla faccia della terra.
Agli eroi non resta che contemplare il tramonto e ricordare il coraggioso amico sulle tristi note dell'armonica di Hayato.
Ma una nuova minaccia si staglia all'orizzonte: una nuova malefica organizzazione intende controllare il pianeta.
E' l'esercito dei Demoni, guidato dal malvagio Imperatore Brai.
Quando l'umanità credeva di aver concluso la guerra si sbagliava: un nuovo conflitto sta per cominciare e la squadra Getta dovrà nuovamente scendere in campo per la pace e la libertà del genere umano.